A lo largo de más de 200 años (de 1801 a la fecha) según archivos fidedignos, cientos de hogares se enlutaron en Calkiní, hablando del municipio, con los estragos de enfermedades como el cólera morbus, la influenza española y la viruela negra. La ignorancia de la gente por un lado y por otro los escasos avances de la medicina causaron estragos en la población.Entre los años de, 1853 y 1854, en Calkiní, como en todo México, el "viajero del Ganges" como le llamaban al cólera Morbus, cobró la vida de cientos de habitantes. En Calkiní en noviembre de 1853, 10 muertos y en diciembre 23. En enero de 1854, 41 muertos y en febrero 46.

En Dzitbalché en diciembre de 1853, 31 muertos y en noviembre del mismo año 53. En enero de 1854, 11 fallecidos; en agosto, 25 y en septiembre, 115 y en Sacabchén en septiembre del '54, 78 personas. En Calkiní en octubre de 1854, 146 difuntos por cólera. Se ignoran los datos de Bécal y Nunkiní con las poblaciones a su cargo que tenían las iglesias. En 1916 se presenta la epidemia de la viruela negra causando estragos aunque menos que el cólera morbus y del 1o de julio de 1918 al 31 de junio de 1919 fallecen por la "influenza española" en Calkiní 114; en Dzitbalché 62; en Nunkiní 141 y en Bécal 21. En la actualidad, el gobierno federal a través del sector salud toma las medidas preventivas y con las campañas para controlar muchas enfermedades como el paludismo,el dengue, la viruela, el sarampión, etc. y el corazón que ponen las enfermeras en su labor recorriendo a pie las calles de la población bajo el sol ardiente casa por casa y escuela tras escuela todos estos males ya van siendo erradicados paulatinamente. Nuestro agradecimientos a las hijas de Florencia Nightingale por su arduo trabajo todo el año.